Der Ursprung des Zoo am Meer war ein Nordsee-Aquarium. Im Jahre 1913 wurde es als eine Wartehalle für Anlegezwecke des Norddeutschen Lloyd eröffnet. Erst im Jahr 1928 kam ein kleines Außengelände hinzu, auf dem auch Säugetiere und Vögel gezeigt wurden. Durch die Lage direkt am Deich und die guten Kontakte zur Schifffahrt war es immer möglich, natürliches Meerwasser für die Aquarien zu nutzen und immer besondere Meerestiere zeigen zu können. In den Jahren 2001 bis 2004 erfolgte der komplette Umbau des Zoo am Meer, zunächst ohne Aquarium. 2013 erfolgte dann der Bau des Nordsee-Aquariums - ein faszinierendes „Fenster zur Nordsee“.